Klinisk diagnose er kun pålidelig i tilfælde af lobær lungebetændelse, men sandsynligheden for pneumokok-ætiologi ved samfundserhvervet lungebetændelse, mellemørebetændelse og bihulebetændelse er 60-80°. Diagnosen kan kun verificeres på baggrund af resultaterne af mikrobiologisk undersøgelse af det tilsvarende biosubstrat: i tilfælde af rhinitis - næseflåd (udstrygning), i tilfælde af mellemørebetændelse og bihulebetændelse - purulent ekssudat, i tilfælde af lungebetændelse - sputum, i tilfælde af meningitis - cerebrospinalvæske.