Ved primær tuberkulose er læsionen normalt lokaliseret i lymfeknuder, lunger, pleura og undertiden i andre organer: nyrer, led, knogler, bughinde. Området med specifik inflammation kan være meget lille og forblive skjult under undersøgelse. Hvis læsionen er stor, opdages den normalt under klinisk og radiologisk undersøgelse af patienten.