HCV-genomet er repræsenteret af et enkeltstrenget positivt ladet RNA, som koder for 3 strukturelle (nukleokapsidproteinkerne og nukleoproteiner i kappens E1-E2) og 5 strukturelle (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) proteiner. AT'er syntetiseres for hvert af disse proteiner, som findes i blodet hos patienter med viral hepatitis C.